协议部分条款无效并不会导致整个协议无效。《民法典》规定，民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效，违背公序良俗的民事法律行为无效。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》第一百五十三条
违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。
违背公序良俗的民事法律行为无效。
第一百五十六条
民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。
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