协议有效，无论是公司变更登记还是工商变更登记，都不是股权转让协议的生效要件。只要股权转让协议是当事人的真实意思表示，符合法律规定的转让条件，应当认定股权转让协议生效。股东名册变更登记或者工商变更登记，是在股权转让协议生效并履行后才可进行。风险提示：股权转让协议签订后，转让方应配合受让方完成股东名册记载和公司章程修订等公司内部手续，并尽快前往工商部门办理登记变更手续，形成对外公示效力和影响，避免日后发生不必要的权利纠纷。
法律依据
《公司法》第七十一条
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