两轮电动车酒驾肇事逃逸的处理如下：
1、对造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的，由公安机关处200元到2000元罚款，可以并处15以下拘留；
2、对发生重大交通事故，构成犯罪，没有逃逸的，除依法追究刑事责任外，由公安机关吊销机动车驾驶证等。
交通肇事罪逃逸的认定：
1、明知发生交通事故，交通事故当事人驾车或弃车逃离事故现场的；
2、交通事故当事人认为自己对事故没有责任，驾车驶离事故现场的；
3、交通事故当事人有酒后和无证驾车等嫌疑，报案后不履行现场听候处理义务，弃车离开事故现场后又返回的。
法律依据：《中华人民共和国道路交通安全法》第一百零一条
违反道路交通安全法律、法规的规定，发生重大交通事故，构成犯罪的，依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。
造成交通事故后逃逸的，由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证，且终生不得重新取得机动车驾驶证。
第一百零二条
对六个月内发生二次以上特大交通事故负有主要责任或者全部责任的专业运输单位，由公安机关交通管理部门责令消除安全隐患，未消除安全隐患的机动车，禁止上道路行驶。
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