法律分析：
虽然被派遣员工系与派遣单位建立劳动关系，应由派遣单位支付工资，但实际上该工资是体现在用工单位支付给派遣单位的派遣费用中的。派遣单位违法法律规定，侵害派遣员工权益的，用工单位应承担连带责任。其中，就包括了派遣单位侵吞派遣员工工资这一情况。因此，建议就员工工资这部分，由用工单位直接支付给派遣员工，以免不法派遣单位卷款而逃。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》
第六十一条 劳务派遣单位跨地区派遣劳动者的，被派遣劳动者享有的劳动报酬和劳动条件，按照用工单位所在地的标准执行。
第六十三条 被派遣劳动者享有与用工单位的劳动者同工同酬的权利。用工单位无同类岗位劳动者的，参照用工单位所在地相同或者相近岗位劳动者的劳动报酬确定。
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