修理厂合同纠纷的处理方式：
1、协商。当事人可以通过协商，达成协议来解决纠纷。
2、调解。当事人不能协商一致的，可向有关机构申请调解。
3、仲裁。当事人还可以根据协议中规定的仲裁条款或达成的仲裁协议申请仲裁。
4、诉讼。如果协议中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，当事人也可以通过诉讼解决。
【本文关联的相关法律依据】
《民法典》第二百三十三条
物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。
《民事诉讼法》第三条
人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。
《人民调解法》第二条
本法所称人民调解，是指人民调解委员会通过说服、疏导等方法，促使当事人在平等协商基础上自愿达成调解协议，解决民间纠纷的活动。
《仲裁法》第二条
平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
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