回迁房契税的缴纳流程包括提交资料、申报纳税和缴纳税款，其中纳税人需凭纳税申报表到窗口开具完税证，并到指定代理银行缴纳税款。另外，纳税人凭完税证办理房产证，最后需要凭契税完税凭证或减免税证明、不征契税证明到土地、房产管理部门办理权属变更登记手续。
法律分析
回迁房契税在哪里缴纳
一、提交资料的地点：纳税人按下列类别向房地产交易中心办理。
二、申报纳税的地点：纳税人凭房地产交易中心受理单向窗口申报纳税，窗口打印纳税申报表交纳税人。即办。
三、缴纳税款的地点：纳税人在10日内凭纳税申报表到窗口开具完税证，并到制定代理银行缴纳税款。
其他说明：
1、房地产交易中心通过网络向窗口传递纳税信息。
2、纳税人凭完税证到房地产交易中心办理房产证。
回迁房契税缴纳流程
一、纳税人领取、填写《契税纳税申报表》，并按房屋、土地交易类型提供相关资料。
二、受理人员对《契税纳税申报表》和纳税人提供的资料进行初审。初审未通过的，受理人员应告知纳税人不通过的原因，并指导纳税人重新填写《契税纳税申报表》或补充需要的相关资料，初审通过的，由受理人员签收《契税纳税申报表》及相关资料。
三、初审通过决定受理后，审核人员对纳税人提供的资料进行审核。
(一)属缴纳税款的：
1、将纳税人申报的房屋、土地的成交价格与评估价格、市场价格进行比对，核定纳税人房屋、土地的计税价格，计算纳税人应缴纳的税款，出具审核意见，制作《房地产交易纳税申报审核表》。
2、将经审批的《房地产交易纳税申报审核表》的计税数据交纳税人进行签章确认。
3、将盖有地税部门征收章的《房地产交易纳税申报审核表》传递给开票人员。
4、纳税人缴纳税款，领取契税完税凭证。
(二)属减免税的：转入税收减免税办理程序，审核人员将纳税人的相关资料报主管契税征收机关，由主管契税征收机关按减免税的有关规定办理，并办理减免税证明。
(三)属符合不征契税规定的，审核人员制作《房地产交易纳税申报审核表》。出具不征税款的审核意见报审批。审批通过的，制作不征契税证明。
四、纳税人凭契税完税凭证或减免税证明、不征契税证明到土地、房产管理部门办理权属变更登记手续。
结语
回迁房契税缴纳流程简单明了。纳税人需到房地产交易中心提交资料，然后在窗口申报纳税并缴纳税款。交易中心通过网络传递纳税信息，纳税人凭完税证办理房产证手续。办理权属变更登记时，需携带契税完税凭证或减免税证明、不征契税证明。流程规范，便捷高效。
法律依据
中华人民共和国城市维护建设税法： 第三条 契税税率为百分之三至百分之五。
契税的具体适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的税率幅度内提出，报同级人民代表大会常务委员会决定，并报全国人民代表大会常务委员会和国务院备案。
省、自治区、直辖市可以依照前款规定的程序对不同主体、不同地区、不同类型的住房的权属转移确定差别税率。
中华人民共和国城市维护建设税法： 第十条 纳税人应当在依法办理土地、房屋权属登记手续前申报缴纳契税。
中华人民共和国契税法： 第三条 契税税率为百分之三至百分之五。
契税的具体适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的税率幅度内提出，报同级人民代表大会常务委员会决定，并报全国人民代表大会常务委员会和国务院备案。
省、自治区、直辖市可以依照前款规定的程序对不同主体、不同地区、不同类型的住房的权属转移确定差别税率。